User:Omer banisalamah

تهجين الحمض النووي يشير تهجين الحمض النووي-DNA بشكل عام إلى تقنية البيولوجيا الجزيئية التي تقيس درجة التشابه الوراثي بين برك تسلسلات الدنا. وعادة ما يستخدم لتحديد المسافة الجينية بين اثنين من الكائنات الحية. وقد استخدم هذا على نطاق واسع في مجال التصنيف والتصنيف.

الطريقة يتم تمييز الحمض النووي لكائن واحد ، ثم يتم مزجه مع الحمض النووي غير المصنّف ليتم مقارنته. يتم تحضين الخليط للسماح لفواصل الحمض النووي بالفصل ثم تبريده ليشكل دنا مزدوج الهجين مجدّد متجدد. سوف تترابط التسلسلات المهجنة مع درجة عالية من التشابه بقوة أكبر ، وتتطلب المزيد من الطاقة لفصلها: أي أنها منفصلة عند تسخينها عند درجة حرارة أعلى من التتابعات المتباينة ، وهي عملية تعرف باسم " ذوبان الدنا ".

ولتقدير درجة انصهار الدنا المهجن ، يرتبط الدنا المزدوج الشريطة بعمود ويتم تسخين الخليط بخطوات صغيرة. في كل خطوة ، يتم غسل العمود. تصبح التسلسلات التي تذوب مفردة تقطعها وتغسل العمود. تعكس درجات الحرارة التي يأتي بها الدنا المصنف من العمود مقدار التشابه بين التسلسل (وتخدم عينة التهجين الذاتي كعنصر تحكم). يتم الجمع بين هذه النتائج لتحديد درجة التشابه الجيني بين الكائنات الحية

استخدم في علم الحيوان عندما تتم مقارنة العديد من الأنواع بهذه الطريقة ، تسمح قيم التشابه بترتيب الأنواع في شجرة التطور ؛ ولذلك ، فإن أحد المقاربات الممكنة لتنفيذ النظاميات الجزيئية. استخدم تشارلز سيبلي وجون ألكويست ، رواد هذه التقنية ، تهجين الحمض النووي-الحمض النووي لفحص العلاقات السكانية المتكونة من الطيور ( تصنيف Sibley-Ahlquist ) والرئيسيات.

لاستخدام في علم الأحياء الدقيقة تهجين الحمض النووي-الحمض النووي هو المعيار الذهبي للتمييز بين الأنواع البكتيرية ، مع وجود قيمة تشابه أكبر من 70٪ مما يشير إلى أن السلالات المقارنة تنتمي إلى أنواع متميزة. [3] [4] [5] في عام 2014 ، تم اقتراح عتبة تشابه 79 ٪ لفصل السلالات البكتيرية. [6]

لاستبدال بواسطة تسلسل الجينوم يقول النقاد أن هذه التقنية غير دقيقة للمقارنة بين الأنواع ذات الصلة الوثيقة ، حيث أن أي محاولة لقياس الاختلافات بين تسلسلات متشابهة بين الكائنات الحية تطغى عليها تهجين تسلسلات باروالوجية داخل جينوم الكائن الحي. [7] تسلسل الحمض النووي والمقارنات الحسابية للتتابعات هو الآن بشكل عام طريقة لتحديد المسافة الجينية ، على الرغم من أن التقنية لا تزال تستخدم في علم الأحياء الدقيقة للمساعدة في تحديد البكتيريا. [8]

الطريقة الحديثة هي إجراء تهجين DNA – DNA في silico باستخدام جينوم متسلسل بشكل كامل أو جزئي. [9] إن GGDC المطورة في DSMZ هي الأداة الأكثر دقة لحساب القيم المماثلة لـ DDH. [9] من بين التحسينات الخوارزمية الأخرى ، يحل المشكلة مع تسلسلات paralogous عن طريق ترشيحهم بعناية من المباريات بين تسلسل جينوم اثنين